Doktora Programları enstitüler tarafından yürütülür. Doktora programlarının normal süresi 4 yıldır ve program bitirildiğinde doktora derecesi alınır. Üniversitemizde Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Sosyal Bilimler Enstitüsü ve Fen Bilimleri Enstitüsü şeklinde 3 enstitü vardır. Üniversitemizde öğrenci alan Doktora Programları şunlardır :